期刊論文：
Kung, P.Y.; Wang, Y.T.; Chiu, J.C.; Hsu, Y.C.; Wu, T.N.; Shen, Y.H.; Wen, S.B.(2011) “Comparison of indoor air quality measurement by using direct detection apparatus and standard methods”, Advanced Materials Research, 230-232, 905-909.(EI)
Wang, Y.T.; Chiu, J.C.; Hsu, Y.C.; Wu, T.N.; Shen, Y.H.; Wen, S.B. (2011)“Investigation on indoor air quality of public sites in Tainan area”, Advanced Materials Research, 255-260, 1413-1417.(EI)
Hsien, K.J.; Wang, Y.T.; Hsu, Y.C.; Wu, T.N.; Shen, Y.H.; Wen, S.B. (2012)“Indoor air quality investigation of public sites in isolated islands within Taiwan37Strait”, Applied Mechanic and Materials, 209-211, 1576-1579.(EI)
Chien-Jung Lin, Jih-Ming Chyan, I-Ming Chen, Yi-Tun Wang, Swift model for a lower heating value prediction based on wet-based physical components of municipal solid waste, Waste Management, Available online 11 December 2012.(SCI)
Chien-Jung Lin, Yi-Tun Wang, Kuo-Jung Hsien, Ying I. Tsai, Pei-Yi Kung, Jih-Ming Chyan, In Situ Rapid Evaluation of Indoor Bioaerosols Using an ATP Bioluminescence Assay, Aerosol and Air Quality Research, 13, 1313-1320. (SCI)
研討會論文：
林健榮、王怡敦、張翊峰、黃皓謙、駱怡君、張祖恩,“燃煤飛灰礦物組成對其去除水中銅離子之影響”，第二十八屆廢水處理技術研討會，(2003)
許逸群、申永輝、邱瑞基、吳庭年、王怡敦、張神鳳，“中醫艾灸療程釋出醛類物質之調查與分析”，第十三屆海峽兩岸環境保護學術研討會（重慶）(2010)。
張神鳳、邱瑞基、王怡敦、江志欽、許逸群，「室內空氣品質調查與檢測方法比對-以醫療院所為例」，中華民國環境工程學會空氣污染控制技術研討會(2010)。
江志欽、許逸群、邱瑞基、王怡敦，「南部地區室內空氣中生物氣膠特徵」，第二十五屆環境分析化學研討會，行政院環境保護署環境檢驗所，桃園(2011)。
陳孟甘、江志欽、許逸群、吳庭年、王怡敦，「冷光儀偵測室內空氣微生 物活性特徵之研究」，第二十五屆環境分析化學研討會，行政院環境保護署環境檢驗所，桃園(2013)。
楊雅倫、黃小林、李美貴、王怡敦，「以Bertin 空氣採樣器評估室內生物氣膠之研究」，2015 職業衛生研討會，嘉南藥理大學，民國104 年3 月。
蔡明道、鄭淑燕、謝宗錡、王怡敦、楊奇儒，「解析室內不同場所空氣中揮發性有機物特徵成分之研究」，中華民國環境工程學會第二十八屆年會 空氣污染控制技術研討會(2016)。
林紀壯、蔡瀛逸、王怡敦、鄭淑燕、葉玉麟，「空氣中PM2.5 自動監測值線性迴歸模式之研究」，中華民國環境工程學會第二十八屆年會 空氣污染控制技術研討會(2016)。
張家彰、王怡敦、陳英峰、米孝萱，「我國運動健身場所中二氧化碳濃度時空分佈之研究」，第31屆國際氣膠科技研討會暨2024細懸浮微粒(PM2.5) 管制及空氣品質與淨零排放議題研討會(2024)。
Y. T. Wang, C. J. Lin, S.P. Li, J.C. Wang, and P. Y. Kung, Swift Model for Lower Heating Value Prediction Based on Wet-basis Physical Components of Municipal Solid Waste in Taiwan, 2008 International Conference on Environmental Quality Concern, Control and Conservation, May 23-24, 2008, Tainan, Taiwan.
Chien. Jung. Lin, Y. T. Wang, Y. F. Chang, H. C. Huang, I. C. Lo, J. E. Chang, Effects of Mineral Composition in Coal-Burn Fly Ash on the Adsorption of Cu(II) from Aqueous Solution, Asian-Pacific Regional Conference on Practical Environmental Technologies, Dec. 18~21, 2003, Tainan, Taiwan.